化合物的分子通过它的氢原子，与同一分子（或另一分子）中含有未共用电子对且“电负性”较大，而原子半径较小的原子（如O、N、Cl、F等）联系而形成的键。如水、醇等的“分子缔合”现象，蛋白质和核酸分子的立体结构，均与氢键的形成有关。这种键和普通化学键不同，键长较长而键能较小，容易遭到破坏。氢键的存在，往往对化合物的性质有显著影响，如增高沸点、增大溶解度等。