《马关条约》规定台湾割予日本，举国共愤。康有为联合一千三百余名举人上书光绪帝，竭力反对割台，主张迁都抗战。各界人士以罢市、发布檄文、通电、上书等方式强烈抗议。台湾人民更是“捶胸泣血，万众一心，誓同死守”。1895年（清光绪二十一年）5月，清廷令台湾巡抚唐景崧率大小官吏“内渡”。6月2日，派李经方与日方办理交割手续。基隆、台北相继失陷。帮办台湾军务刘永福以黑旗军为骨干，团结各路义军奋勇抗战。吴汤兴、徐骧、姜绍祖等民众武装在新竹一带屡挫日军，因粮械不济南撤，合刘永福部节节拒敌。9月，在彰化保卫战中伤亡惨重。10月，爱国军民艰苦御守嘉义、台南，重创日军，义军首领徐骧和守将王德标均力战阵亡，台南失陷。台湾军民坚持抗战五个月，日军投兵力五万余，伤亡及疾病遣返者三万余人，始最后占领台湾全岛。