亦称“细胞分室化”。细胞内因酶和代谢物的不均匀分布而分化为不同的区域。细胞内有各种细胞器，每种细胞器内具有一组酶进行着特定的代谢活动。一个细胞器就是一个区域。如叶绿体内进行光合作用，线粒体内进行生物氧化。细胞的区域化能使细胞内的各种代谢反应有序地进行。