能引起胚胎发育障碍的物理、化学、生物等因素。常见的有：电离辐射，如γ射线、X射线；药物和化学毒物，如反应停、甲基汞；病毒和寄生虫，如风疹病毒、弓形虫。这些因素只有作用于特定的胚胎发育期才具有致畸性。在一定的剂量范围内，致畸作用强度与剂量有关。畸形类型和发生频率尚取决于致畸原作用于胚胎发生的时间。人的胚胎器官发育期（受精后第3～8周）对致畸原高度敏感。常见的畸形有无脑儿、脊柱裂、脑积水、腭裂、唇裂、心房室间隔缺损、消化道狭窄及闭锁、尿道下裂、肢体畸形及唐氏综合征等。孕期慎用药物和避免放射线接触，可防止发生畸形儿。