等位基因在减数分裂时互相分开，进入不同配子。一对等位基因的杂合体，例如Aa，在减数分裂时相互分离，形成A和a两种配子。这些配子随机受精，形成AA、Aa和aa三种合子，成1∶2∶1之比，这是遗传型的分离比。如A对a是显性，表型分离比为3∶1。分离现象是生物界的普遍现象，是孟德尔定律的基本内容，也是杂种不能真实遗传的原因。