在有些细菌中发现的一类脱氧核糖核酸的内切酶。它们各自选择脱氧核糖核酸分子长链上的特定位点，将其切断。切点的核苷酸顺序常具有*回文结构的特征。有些酶还会切出单链末端，互补的单链末端可以重新粘合，故称“粘性末端”。限制性内切酶是研究基因结构、顺序和进行基因工程的重要工具酶。在细菌中，它可能是一种防御系统，能破坏进入细胞的外源脱氧核糖核酸。