确定基因在染色体上的位置和基因间的排列顺序和距离工作。在高等生物中，可用基因组的频率来测量，以1%重组作为距离单位。应用经典的*三点试验，可以通过一次杂交测定三个基因在染色体上的相对位置和以重组频率作为单位表示的相互之间的距离。在大肠杆菌中，可用杂交过程中染色体转移的时间来测量，以分钟作为距离单位。应用分子生物学技术，如原位杂交，核苷酸测序等，可以把基因定位更精确地落实到核苷酸链上的特定顺序上。