针对自身的正常或改变了的组织、细胞、体液成分的特异性体液免疫（由自身抗体介导）或细胞介导免疫。机体由于感染、手术、药物、辐射等外因改变了自身物质的理化性状，使自身组织成分成为能被免疫系统所识别的自身抗原，因而产生了免疫反应，导致组织损伤时就形成了自身免疫病。如溶血性贫血、慢性甲状腺炎、全身性红斑狼疮等。