通过改变染色体组的数量或结构，产生不同的变异个体，进而选育成新类型或新品种的育种方法。染色体组的结构变化指非整倍体，有缺体、单体、二体、三体、四体、多体、异附加系和异代换系等。其中，只有异附加系和异代换系是育种目标。数量变化是指整倍体，可分同源多倍体和异源多倍体。根据倍数性的分类，育种方法也可相应分为同源多倍体育种、异源多倍体育种和非整倍体育种三大类。