清顺治十一年（1654年）由于宦官吴良辅等的怂恿设立十三衙门，在宫廷内侍奉皇室及其家族，以宦官为主管。十三衙门为：司礼监、御用监、御马监、内官监（宣徽院）、尚衣监、尚膳监、尚宝监（尚宝司）、司设监、尚方司（尚方院）、惜薪司、钟鼓司(礼仪监、礼仪院)、兵仗局、织染局(经局)。与明代之*二十四衙门相似。十八年康熙帝即位后裁撤。