子囊菌产生子囊孢子的细胞。其形成过程多样，以脉孢菌为例，产囊丝受精质配后，双核菌丝顶部伸长并弯曲形成产囊丝钩，同时两核各分裂一次，在有隔膜产生后，顶端的一个双核细胞通过核配而形成子囊母细胞。由它伸长并经三次细胞分裂，其中第一次为减数分裂，形成有8个孢子的子囊。子囊菌的子囊孢子数亦有4或32以上的。