不同种的生物间的交配。远缘杂交的一种。如马和驴的杂交，陆地棉与海岛棉的杂交等。种间杂交常出现杂交不亲和及杂种育性低等，且杂种后代分离世代长，难以稳定。但后代变异类型多、范围广，可得到一般品种间杂交难以得到的变异类型。