亦称“物质流”。指碳、氢、氧、氮、磷、硫等组成生物有机体的基本元素在生态系统的生物群落与无机环境之间的物质转换与能量传递过程。如碳循环：大气中的二氧化碳被陆地和海洋中的植物吸收，然后通过生物或地质过程，以及人类活动，又以二氧化碳的形式返回大气中。磷和硫同样也是以无机物变换为有机物，然后再变换成无机物的形式进行循环。