俗称“磷细菌肥料”。利用某些具有分解有机磷或无机磷化合物能力的细菌生产的菌剂。可分有机磷细菌肥料和无机磷细菌肥料两种。前者主要为解磷巨大芽孢杆菌（Bacillus megatherium var. phosphaticum）等，以分解核酸、卵磷脂等为主；后者主要为一些不生芽孢的产酸小杆菌，以产酸能力较强能溶解磷灰石而被应用。