词条 | 晶体结构分析 |
释义 | jingti jiegou fenxi 晶体结构分析(卷名:物理学) crystal structure analysis 晶体学中的一个重要的领域,它研究晶态物质内部在原子尺度下的微观结构。它为固体物理学、材料科学、结构化学、分子生物学、矿物学、医药学等许多学科的基础研究和应用研究提供必不可少的实验资料,使人们有可能从分子、原子以及电子分布的水平上去理解有关物质的行为规律。 按所用试样的不同,晶体结构分析有多晶体分析和单晶体分析两类;按所用手段的差异,晶体结构分析又有X 射线衍射分析、电子衍射和电子显微分析、中子衍射分析三种。 单晶体 X射线衍射分析是晶体结构分析中比较成熟的一种。它已经建立起比较完善的理论体系和实验技术。目前,复杂到分子量达数万的生物大分子的晶体结构已经被大量测定出来。至于测定一个中等复杂程度(晶胞中除氢原子外含有约50个独立原子)的晶体结构,一般只需一周时间。所测得原子坐标的精度可达10-3埃量级。 单晶体X射线衍射分析的理论依据是:晶体结构同晶体的X射线衍射效应之间存在着傅里叶变换的关系。晶体的X射线衍射效应源出于电子对X 射线的相干散射,而原子核对X射线的散射能力与电子相比可以忽略不计。因此用X射线衍射方法测定晶体结构时,晶体结构可以用一个晶胞中的电子密度分布函数ρ(r)来表示。其中r=xa+yb+zc,是晶胞中一个点的位矢,x、y、z是分数坐标,a、b、c是表示晶胞中相交于一点的三个边的边长和取向的矢量。晶体学中的衍射效应指的是周期性物体上所发出的散射波的叠加结果。一个晶胞对于各不同方向上衍射波振幅的贡献同一个电子在相应方向上的散射波振幅之比,是描述晶体的X 射线衍射效应的一个物理量。这个量同所用X射线的强度、晶体试样的大小、形状等因素无关,称为结构因数并记作F(H)。其中H是衍射矢量,根据劳埃条件(见X射线衍射),它同X射线入射波的波矢k0和衍射波的波矢k有如下关系:H=k-k0,波矢的方向平行于波动传播的方向,其长度等于波长的倒数。此外,H 又是倒易点阵中一个阵点的位矢, 即H=ha*+kb*+lc*其中h、k、l是三个整数,称为衍射指数,a*、b*、c*是表示倒易晶胞中相交于一点的三个边的边长和取向的矢量,它们同a、b、c有如下关系: a*·a=b*·b=c*·c=1, a*·b=a*·c=b*·a=b*·c=c*·a=c*·b=0可以证明,结构因数同电子密度分布函数之间存在着傅里叶变换的关系: ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 尝试法 这种方法的特点是先假设一个或者几个可能的结构模型,然后用实验结果加以鉴定和改善。假设一个结构模型,就要给出晶胞中每个原子的种类和坐标。这样就有一套 fj和rj。以此代入式(3)就可以求得相应于这个模型的结构因数的计算值: ![]() ![]() 傅里叶综合法 这种方法需要有一套大致上正确的位相。这样一套位相可以由一个假设的模型计算求得,也可从其他途径获得。一旦得到一套位相的计算值αc(H),就可同实验测得的|F0(H)|相配合,用 ![]() ![]() 帕特孙法 这是1934年由A.L.帕特孙提出的方法。这方法绕开了位相问题,直接用实验测得的|F0(H)|去计算一个所谓帕特孙函数 ![]() ![]() 同晶型置换法 如果两种晶体的空间群(见晶体的对称性)相同、晶胞参数非常接近,原子在晶胞中的分布除少数外也非常相近,则这两种晶体称为同晶型的晶体。如果在一种晶体的晶胞中设法增、减或替换少数原子而保持其余不变,这叫做同晶型置换。假如通过同晶型置换获得三种同晶型晶体,它们的共同部分是P,不同部分是Q1、Q2、Q3,那么这三种晶体的结构因数可以写成 ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() ![]() 直接法 所谓直接法就是从一组结构因数的绝对值|F(H)|直接推引出它们的位相的方法。从直接法的观点看来,结构因数的位相并没有丢失,而是隐含在实验中观察到的结构因数绝对值当中。 由式(3)和式(4)可得: ![]() ![]() ![]() α(H)≈α(H′)+α(H-H′) (14)和 ![]() 晶体结构分析计算程序 晶体结构分析需要处理大量实验数据并对这些数据作各种繁复的运算。因此现代的电子计算技术对晶体结构分析的发展起着关键性的作用。从50年代开始晶体结构分析就利用了电子计算机;60年代,国际上就已出现比较成熟的标准化的晶体结构分析程序系统;70年代,这种程序系统已见于商品。一个晶体结构分析程序系统通常包含以下几个功能:①原始数据处理,②傅里叶变换运算,③位相推引(直接法),④原子参数的最小二乘法精化,⑤结构模型的分析和绘图。 参考书目 G.H.W.Milburn,X-Ray Crystallography,An Intro-duction to the Theoty and Practice of Single-Crystal Structure Analysis,Butterworths,London, 1973. M.J.Buerger,Vector Space and its Applicationin Crystal Structure Investigation,John Wiley & Sons,New York,1959. M.F.C.Ladd and R. A.Palmer,ed.,Theory and Practice of Direct Methods in Crystallography,Plenum Press,New York,1980. |
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