亦称“微生物肥料”，简称“菌肥”或“菌剂”。含有土壤中有益微生物的接种剂。由一种或数种有益微生物、培养基质和添加物（载体）培制而成。施用后，通过微生物的生命活动能改善作物营养状况。有根瘤菌肥料、固氮菌肥料、磷细菌肥料、钾细菌肥料以及菌根真菌的接种剂等。有些具有抗菌作用和刺激植物生长作用的放线菌，也已发展为菌肥。